Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms