Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX1Q9NSU2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms