Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms