Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM27Q9HBJ8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms