Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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