Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSDMCQ9BYG8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSDMCQ9BYG8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms