Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms