Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms