Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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