Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms