Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms