Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms