Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms