Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FGD4Q96M96 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms