Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms