Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf44Q96CB5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf44Q96CB5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms