Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms