Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 PARP16-205ENST00000560149 823 ntTSL 59.68□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 PARP16-203ENST00000558873 838 ntTSL 56.71□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.987e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.887e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 CEP78-208ENST00000476652 634 ntTSL 319.35■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.657e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 28
DGCR8Q8WYQ5 FAAP20-207ENST00000420515 1544 ntTSL 1 (best)26.62■■□□□ 1.852e-7■■■■■ 27.9
DGCR8Q8WYQ5 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC7.27□□□□□ -1.256e-11■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 PLD1-213ENST00000481505 491 ntTSL 47.96□□□□□ -1.141e-8■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 PILRB-203ENST00000431140 772 ntTSL 314.04□□□□□ -0.165e-21■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.015e-21■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 LINC-PINT-202ENST00000423414 616 ntTSL 421.38■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 LINC-PINT-204ENST00000431189 803 ntTSL 318.73■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 LINC-PINT-205ENST00000433079 1262 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 LINC-PINT-206ENST00000435523 553 ntTSL 34.24□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 314.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 27.8
DGCR8Q8WYQ5 PTPRE-207ENST00000471218 522 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 27.7
DGCR8Q8WYQ5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 27.7
DGCR8Q8WYQ5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 27.7
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 510.75□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 27.5
DGCR8Q8WYQ5 KIAA1522-205ENST00000468130 684 ntTSL 223.82■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 27.5
DGCR8Q8WYQ5 HOXB7-203ENST00000567101 528 ntTSL 210.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 27.4
DGCR8Q8WYQ5 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 27.4
DGCR8Q8WYQ5 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 512.33□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 27.4
DGCR8Q8WYQ5 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 510.03□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 27.4
DGCR8Q8WYQ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.766e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.96e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 PLCL1-202ENST00000435320 6665 ntTSL 219.09■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.15□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 RCOR3-211ENST00000528926 1497 ntTSL 212.73□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 MIR3911-201ENST00000577791 109 ntBASIC8.46□□□□□ -1.066e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 SRPK2-210ENST00000477925 1336 ntTSL 58.32□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 SRPK2-207ENST00000466917 2565 ntTSL 28.05□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 PLCL1-205ENST00000487695 3083 ntTSL 57.65□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 CLK1-210ENST00000473565 3208 ntTSL 1 (best)6.48□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 CLK1-207ENST00000461981 3173 ntTSL 26.24□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 CLK1-202ENST00000409403 1664 ntTSL 55.89□□□□□ -1.476e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 RCOR3-213ENST00000529763 720 ntTSL 55.55□□□□□ -1.526e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.556e-7■■■■■ 27.3
DGCR8Q8WYQ5 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.576e-7■■■■■ 27.3
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DGCR8Q8WYQ5 SRPK2-208ENST00000474770 872 ntTSL 34.04□□□□□ -1.766e-7■■■■■ 27.3
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DGCR8Q8WYQ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 27.2
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DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 518.01■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 NXF1-210ENST00000531579 590 ntTSL 414.29□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 NXF1-207ENST00000530875 1922 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 SERBP1-207ENST00000490406 624 ntTSL 511.9□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 NXF1-203ENST00000526163 569 ntTSL 411□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 NXF1-208ENST00000531131 1023 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 27.2
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 27.2
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