Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms