Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNE4Q8N205 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms