Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms