Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APTXQ7Z2E3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms