Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms