Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC141Q6ZP82 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC141Q6ZP82 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms