Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms