Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms