Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms