Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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