Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPIN4Q56A73 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPIN4Q56A73 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms