Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms