Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FHOD3Q2V2M9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms