Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms