Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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