Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RTN1Q16799 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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