Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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