Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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