Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXNQ16595 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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