Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CRY1Q16526 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CRY1Q16526 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CRY1Q16526 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CRY1Q16526 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CRY1Q16526 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRY1Q16526 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRY1Q16526 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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