Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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NTRK3Q16288 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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NTRK3Q16288 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms