Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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