Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RYR3Q15413 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RYR3Q15413 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RYR3Q15413 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RYR3Q15413 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RYR3Q15413 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RYR3Q15413 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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RYR3Q15413 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RYR3Q15413 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RYR3Q15413 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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