Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCM1Q15154 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms