Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms