Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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