Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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