Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms