Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRQ13535 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRQ13535 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRQ13535 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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