Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC009245.1-201ENST00000456481 862 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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MKRN4PQ13434 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AP005202.1-202ENST00000583065 748 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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MKRN4PQ13434 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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MKRN4PQ13434 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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