Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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