Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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